《西安交通大学学报(医学版)》（原名《西安医科大学学报》）创刊于1937年，是由国家教育部主管、西安交通大学主办面向国内外公开发行的国家级综合性医学学术刊物。

《西安交通大学学报(医学版)》刊物以本校重点学科为依托，主要报道本校在医学科研、教学、医疗等方面的新成果、新技术和新经验，报道国内外医学新动态、新理论、新进展。内容涉及基础医学、临床医学、预防医学、口腔医学、法医学、药学、祖国医学、生物工程等学科。

《西安交通大学学报(医学版)》被北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊收录，中国学术期刊综合评价数据库来源期刊。